Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms