Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SP140Q13342 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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