Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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