Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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