Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR7

KRTAP3-2, Keratin-associated protein 3-2, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-2Q9BYR7 AL121832.3-201ENST00000616512 3700 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 LAMA4-205ENST00000389463 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ARHGEF9-232ENST00000637417 5114 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ASXL2-202ENST00000404843 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 BTN3A1-202ENST00000289361 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MOG-217ENST00000376891 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MOG-219ENST00000376898 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC245128.2-201ENST00000412970 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MOG-224ENST00000416766 630 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC111152.1-201ENST00000421447 693 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 548 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 OR6W1P-201ENST00000490285 1098 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AP000759.1-201ENST00000531086 397 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AP002840.1-201ENST00000546284 524 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 FLJ21408-202ENST00000565060 565 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC233724.14-201ENST00000603531 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL603764.2-201ENST00000636038 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MAPKBP1-202ENST00000457542 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 IGSF1-201ENST00000361420 4378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 HIF3A-205ENST00000377670 5852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 BX005214.3-201ENST00000615174 1988 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL353770.3-201ENST00000616253 1988 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 TRIM23-201ENST00000231524 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP3-2Q9BYR7 AL590132.1-201ENST00000639602 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms