Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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