Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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