Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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