Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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