Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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