Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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