Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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