Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL4A6Q14031 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL4A6Q14031 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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COL4A6Q14031 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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COL4A6Q14031 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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