Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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PTCH1Q13635 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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PTCH1Q13635 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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PTCH1Q13635 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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PTCH1Q13635 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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