Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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