Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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