Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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