Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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