Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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