Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB39AQ14964 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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