Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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DDX39BQ13838 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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