Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4BQ13620 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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