Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TCIRG1Q13488 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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