Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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