Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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