Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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