Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PGAM1P6-201ENST00000425684 747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL669970.1-201ENST00000444936 450 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZBED5-AS1-201ENST00000501079 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR3125-201ENST00000579927 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL246P-201ENST00000584467 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00649-209ENST00000597626 612 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SPINK6-201ENST00000325630 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms