Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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