Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
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