Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CAPN6Q9Y6Q1 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CAPN6Q9Y6Q1 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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