Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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