Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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