Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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