Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms