Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HECTD4Q9Y4D8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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