Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms