Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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SH3BP1Q9Y3L3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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