Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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