Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL11Q9Y3B7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL11Q9Y3B7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL11Q9Y3B7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL11Q9Y3B7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms