Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms