Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms