Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms