Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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