Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms