Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms