Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms