Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP8AP2Q9UKL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms