Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00527Q9UJ94 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms