Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms