Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms